深湖巨兽的故事发生在二战结束几十年后的加拿大，美国石油公司为了勘测北极冰层下的石油资源，开发出价值50亿美元的高科技设备。但设备却在广袤的加拿大深水湖湖区神秘失踪，消失在一片广袤湖区之中。

　　为了在竞争对手发现之前尽快找到丢失的设备，经验丰富的潜水工程师尚恩不得不中断假期，带着他的儿子和全套搜寻设备一起来到湖区。本以为是和渡假一样轻松的潜水之旅，没想到等待他们的，除了传说中的大水怪，更是一次惊险且精彩的奇幻之旅……