才华横溢却顽固执拗的京师大文学院准博士梁鸿名，在博士论文答辩会上跟委员会主任发生争执，结果论文答辩只获得合格，无法留在京师大任教，再加上找工作也是各种不顺，只好带着爱人邹琴灰溜溜回到徽州。在担任副市长秘书的表弟田衡的牵线下，在担任校人事部主任的同门师兄孙旭东的力促下，梁鸿名进入了母校徽州师大中文系任教，邹琴也进入了校医院当回了护士。两口子兴致勃勃以为即将过上好日子，殊不知这只是一系列麻烦的开始。
梁鸿名一开始进入文学院，就被院长张之野刁难，不给他安排重要的课程，幸亏老教师晏群书主动让出一门课给他。此后梁鸿名又在课题申请上被张之野卡住，张之野还给他硬塞了一个辅导员的职位。田衡和梁鸿名在酒吧抱打不平，帮助了一个驻唱歌手李乐，田衡喜欢上了这个美丽的女子，而梁鸿名劝李乐不要来这地方。后来梁鸿名发现李乐竟然是自己班上的学生。凭借渊博的学识和风趣的授课，梁鸿名很快赢得了新生们的喜爱。
邹琴与昔日好友刘巧重逢，后来又见到了曾经的恋人、刘巧的哥哥刘平，故人相见却物是人非。此时邹琴一门心思想着要完成房子、孩子等目标。听说学校里头有分房指标，邹琴兴冲冲让梁鸿名填表申报，并且让梁鸿名借着田衡的名头给孙旭东施压，最后孙旭东为梁鸿名争取到了分房指标。而梁鸿名见到自己抢占了老教师晏群书的名额，又看到晏群书一家人多年来挤在狭小逼仄的房子里，心里头十分不安，最后把指标转给了晏群书。邹琴生气而无奈。
田衡的前妻郝梅是梁鸿名曾经的恋人，后来和田衡结婚并且又离婚了，然后去了美国。梁鸿名对田衡非常不满，不过两人终究是表兄弟，很多事情互相帮忙。副市长想获得梁鸿名恩师刘一伦的字画作品时，梁鸿名拒绝为田衡提供。刘一伦是一位艺术造诣很高、性情冲淡而又不慕权贵的高人。晏群书患上不治之症，住进了医院，得知大限将至，他支开老伴，回校给学生上最后一课，倒在了讲台。葬礼上，梁鸿名为人品学问俱佳的晏群书宣读了感人悼词。
李乐逐渐喜欢上了梁鸿名，并借着过生日等各种名头对梁鸿名表白，梁鸿名十分被动，一方面享受着被学生爱慕的感觉，另一方面知道不能任由李乐胡闹下去。田衡发现了李乐的身世复杂，父亲在监狱里服刑，弟弟游手好闲。田衡多次对李乐伸出援手，但李乐始终拒绝田衡的追求。有一次李乐脚上受了点伤，田衡把她送到校医院，拜托邹琴好好照顾。邹琴把李乐受伤事由告诉梁鸿名，梁鸿名露出关切神情，邹琴颇为不满，梁鸿名指责她胡乱吃醋。
电视台名家讲坛节目组来徽州师大找人讲课，观察了一圈没有发现既有才华讲课还好的，正要打道回府之际，看到了在草坪上给学生上课的梁鸿名，并诚挚地邀请梁鸿名去讲课。梁鸿名抱着试一试的态度上去讲课，诙谐幽默的风格起到了非常好的效果，得到了观众们的热烈欢迎和社会的追捧。梁鸿名一夜之间成为了炙手可热的学术明星，但很快变得骄傲自大起来，课堂讲课也成了应付。梁鸿名随后在不知情的情况下扯进假酒广告案件，灰头土脸告别了明星生涯。
郝梅带着儿子郝语回到了徽州，约见了梁鸿名。原来她已经患上绝症，生命已然所剩无多。郝梅没有跟前夫田衡见面，让郝语单独去找田衡之后，她直接回了美国。田衡对突然蹦出来的郝语非常不适应，并且以为郝语是郝梅和后一任丈夫的孩子，所以在情感上对郝语产生排斥。不过慢慢随着接触加深，逐渐跟郝语之间建立了父子亲情。后来见到田衡真心待郝语很好，梁鸿名才把郝梅的遗言告诉田衡，原来郝语正是田衡的亲生儿子。
我的博士老公剧照
邹琴在刘巧的撺掇下，开始学习肚皮舞，享受到了其中的乐趣，不过梁鸿名不允许邹琴跳，邹琴只好偷偷去。梁鸿名应聘报社的副总编辑成功，为报社提出了系列改革措施，取得极佳效果。然而在梁鸿名赴京开学术讨论会期间，手下编辑利欲熏心出版了格调低俗的明星传记，最后梁鸿名背起黑锅，引咎辞职离开出版社。此后梁鸿名又凭实力争取到挂职教育局，为解决学生就业，经大学同学、著名企业家许志强帮忙，干了不少实事。李乐和许志强也因此相识。
邹琴经由表姐认识了老总李美辰，在李美辰鼓励下有了自己打拼事业的想法，从校医院辞职。但是梁鸿名多次给邹琴泼冷水。同时又因家长里短以及梁母发病邹琴赶赴不及之事，双方多次冲突。后来李乐在酒店向梁鸿名表白，被邹琴发现并误会，两人无奈离婚。婚后梁鸿名后悔莫及，用各种方式重新追求邹琴，邹琴却不愿复婚，不过她也婉拒了李美辰。邹琴开了一个养生会所，生意惨淡。被梁鸿名拒绝的李乐伤心欲绝生病住院，最后与真诚照顾她的许志强走到了一起。
评教授职称和新世纪人才计划评选时，孙旭东因为田衡面子额外照顾梁鸿名，不料被人举报，梁鸿名陷入风口浪尖，最后辞了各种职称和教育局官职，回归到平淡生活。梁鸿名心系邹琴，甚至为她努力学起了肚皮舞，在广场上卖力宣传，让会所生意火爆起来，邹琴十分感动。梁鸿名参加赴香港教授普通话的项目，去了香港。岁末，邹琴也来到香港，跟梁鸿名冰释前嫌，在贺岁璀璨烟火中相拥。
