六月十七日，京城发生兵变，燕王朱棣率军攻陷都城，继承了帝位。铁铉带着年仅七岁的逊太子朱文奎出逃，被朱棣派的大批高手追捕。万般无奈之下，铁铉夫妇与谢晓峰合演了一场苦肉计，铁铉把太子的服装套在自己亲生儿子的身上，让谢晓峰杀死自己和儿子，以使敌人产生误解就此罢手，不再追捕太子。这幕惨剧被躲在芦苇中不明真相的铁铉之女铁真真看到，她发誓将来要为父母报仇。
三少爷的剑就剧照
铁铉无畏生死，舍生成仁，但谢晓峰从此却只能隐姓埋名，受尽屈辱，他为护主、为正义背上了不忠不孝不义的骂名，父亲不堪家门受辱，自尽身亡，临死前撒下江湖贴，请求天下众英雄诛灭谢晓峰;慕容秋荻已有了身孕，慕容世家深感耻辱，把慕容秋荻赶出家门，在浪荡中慕容秋荻生下一子，在老庄主的授意下，燕十三偷出婴儿，流放河中。慕容秋荻得知后悲痛欲绝。
谢晓峰有家不能回、有亲不能认，落魄乡间沦为酒鬼阿吉，终日以酒为伴。新生的婴儿被卖豆腐的丁财夫妇收养，他们为孩子起名叫“丁小弟”。后慕容秋荻嫁给锦衣卫指挥使纪纲，不久生下了女儿“纪芙蓉”。十多年后，纪芙蓉偶遇谢晓峰和丁小弟，纪芙蓉对丁小弟颇有好感，但所有人都不知道丁小弟和纪芙蓉竟是同母异父的亲兄妹。
十年磨一剑，铁真真终于练成一身绝技，重返中原后，唯一的心愿就是寻谢晓峰报仇。但在与谢晓峰的深入交往中使她渐渐明白了这世上还有比仇恨、比杀戮更重要的东西。丁小弟终于有了出人头地的机会，但他并不知道这些都是生身母亲慕容秋荻的刻意安排。纪纲由妒生恨，筹划了一场大阴谋，想把所有对手一网打尽。
谢晓峰本不想再介入江湖，但正义和良知促使他面对新的挑战。一场明争暗斗因此展开，几方势力经过较量终见分晓，最终正义战胜邪恶，良知唤回真情。燕十三和纪情结合。三少爷谢晓峰回归神剑山庄，丁小弟觉得母亲的死和父亲难脱关系，故虽与父亲相认，但离开。
在武当山上，谢晓峰与燕十三笑谈往事，二人击掌约定要进行一场“真正”地比试，但他们知道剑术的精髓并不在于剑法的本身，而是在于人心善意的积累、人品道德的高尚。
